Anthropic je saopštila da je njena nova biološka laboratorija u oblasti Bay Area već došla do prvog većeg nalaza: dosad neopisanog enzimskog sistema u DNK bakteriofaga, virusa koji napadaju bakterije, sa svojstvima koja podsećaju na CRISPR. Kompanija navodi da su pretragu podataka obavili Claude agenti, a da je sav rad u laboratoriji obavljen rukama ljudi. Nalaz je objavljen kao preprint i još nije potvrđen.
Prema opisu na sajtu Anthropica, reč je o sistemu koji čine reverzna transkriptaza, prateći protein i nizovi ponovljenih DNK sekvenci, po strukturi nalik CRISPR nizovima. Istraživači ga nazivaju ART, od engleskog "array-associated reverse transcriptases". Kompanija tvrdi da sistem može da obavlja operacije poput sečenja, kopiranja i umetanja DNK, ali to je zasad samo hipoteza zasnovana na sličnosti sa poznatim sistemima.
Kako je pretraga tekla
Kako Anthropic opisuje, oko 950 Claude agenata pretraživalo je veliku bazu DNK sekvenci tokom 21 sata, uz potrošnju od oko 210 miliona tokena. Sistem je prikupio više od 200.000 reverznih transkriptaza, suzio ih na oko 3.500 kandidata i na kraju sastavio 20 izveštaja o najzanimljivijim. Iz tog skupa izdvojio se jedan kandidat, koji su ljudski naučnici zatim proverili u laboratoriji.
Prvi eksperimenti, prema saopštenju, pokazuju da ART niz proizvodi posebne kratke molekule RNK. Šta taj sistem zapravo radi u ćeliji, još nije utvrđeno. Autori su i sami naglasili da rezultate dele u ranoj fazi, dok su dalji eksperimenti u toku.
Kako prenosi TechCrunch, Dario Amodei je rekao da je otkriće napravio uglavnom, ali ne u potpunosti, Claude. Amodei je pritom priznao i da su istraživači sa Stanforda ranije opisali sličan sistem, pa se nalaz nadovezuje na postojeći rad, a ne otvara sasvim novu oblast. Feng Zhang, istraživač sa MIT-a i instituta Broad, jedan od pionira CRISPR tehnologije, opisao je rad kao zaista zanimljiv, navodi Anthropic.
Laboratorija u kojoj eksperimente izvode ljudi
Laboratorija je osnovana ovog proleća, a o njenom postojanju Anthropic je javno govorio tek prošle nedelje, o čemu je sajt izvestio u tekstu Anthropic potvrdio laboratoriju za biološke eksperimente. Radi na nivoima biološke bezbednosti BSL-1 i BSL-2, što znači da se ne rukuje ljudskim patogenima. Kompanija naglašava da sve eksperimente izvode ljudski naučnici, uz alate Claude Science i Claude Code, a ponekad i uz sopstveni sistem za usklađivanje većeg broja agenata.
Anthropic ostavlja otvorenim da bi, kako navodi, jednog dana Claude mogao i sam bezbedno da izvodi eksperimente. Zasad to nije slučaj, a ljudi ostaju u petlji na svakom koraku koji uključuje fizički rad.
Biologija je poslednjih meseci jedno od težišta Anthropicovog poslovanja. Kompanija je nedavno pokrenula program provere za nauke o životu, a Claude je, kako je ranije navedeno, ubrzao više od 30 bioloških modela. Farmaceutska kompanija Novo Nordisk uvodi Claude u razvoj lekova. Anthropic je, kako je izvestio The Next Web, ranije poricao da laboratorija služi razvoju lekova, iako su neki mediji pisali suprotno.
Šta ostaje nepotvrđeno
Najvažnije pitanje je nerešeno: funkcija sistema. Sličnost sa CRISPR-om je strukturna, a da li ART može da se koristi za uređivanje gena, tek treba da se pokaže. Preprint nije prošao recenziju, pa će ocenu značaja dati nezavisne laboratorije koje pokušaju da ponove rezultate. Slične AI pristupe biologiji razvijaju i istraživači na Stanfordu, UCSF-u i u Googleu, tako da Anthropic nije jedini u toj trci.
Zanimljiv je i sam metod. Pretraga sa stotinama paralelnih agenata koja u jednom danu pređe preko stotina hiljada sekvenci predstavlja pomak u odnosu na ručni pregled literature, ali Anthropic ne navodi koliko je kandidata sistem odbacio pogrešno i koliko je vremena ljudima trebalo da proveri izdvojeni nalaz. Više o samom modelu i alatima na kojima se ovo zasniva nalazi se na stranici o Claude-u. Ostaje da se vidi da li će nalaz izdržati proveru i da li će se ovakva pretraga pokazati kao ponovljiv metod ili kao jednokratan uspeh.
Često postavljana pitanja
Šta je Anthropic tačno otkrio?
Anthropic navodi da je pronašao enzimski sistem u DNK bakteriofaga koji čine reverzna transkriptaza, prateći protein i ponovljeni DNK nizovi, sa strukturom koja podseća na CRISPR.
Da li je otkriće potvrđeno?
Ne. Rezultati su objavljeni kao preprint, bez recenzije. Prvi eksperimenti pokazuju da sistem stvara kratke molekule RNK, ali njegova funkcija još nije poznata.
Da li je Claude sam izvodio eksperimente?
Ne. Prema Anthropicu, Claude agenti su pretraživali podatke, a sav fizički rad u laboratoriji obavljaju ljudski naučnici.
Može li se ovaj sistem koristiti za uređivanje gena?
To zasad nije poznato. Anthropic navodi da sistem ima svojstva slična CRISPR-u, ali primena zavisi od daljih eksperimenata.
